(一)办公室。负责文电、会务、机要、档案等工作。协助院领导处理检察政务，督促检查有关工作部署的落实情况。负责人大代表、政协委员、特约检察员的联络工作。负责计划财务装备工作。

(二)政治部。负责本院人才队伍建设、思想政治工作、意识形态工作、干部人事工作和离退休人员管理。负责新闻宣传舆论引导等工作。

(三)第一检察部。负责办理本院受理刑事案件(含罪犯又犯罪案件)的审查逮捕、审查起诉、出庭支持公诉、抗诉、开展相关立案监督、侦查监督、审判监督以及相关案件的补充侦查。

(四)第二检察部(司法警察大队)。负责对监狱等执法活动的监督，对刑事判决，裁定执行的监督，强制医疗执行，羁押和办案期限监督。羁押必要性审查。负责对上级检察机关交办的司法工作人员利用职权实施的相关职务犯罪案件的侦查。负责受理向本院提出的控告、申诉和举报，承办本院管辖的国家赔偿案件和国家司法救助案件。负责检察应用理论研究工作，承办本院检察委员会日常工作。负责案件的统一受理流转、办案流程监控涉案财物的监管、法律文书的监管、案件信息公开。组织办案质量评查、业务考评和业务统计分析研判。负责人民监督员工作。指导统一业务应用系统使用。负责检察技术工作。负责检察信息化建设工作。负责对本院执行法律、法规和上级人民检察院的规定、决定情况进行督察。负责司法警察工作。

（五）江西省上饶珠湖地区人民检察院设立驻监狱第一检察室、驻监狱笫二检察室、驻监狱第三检察室3个检察室，均为正科级。